Šiandien žmonės, norintys pristatyti prekes (arba perkelti žmones), gali suvokti, kad ne visada prasminga laikytis tik vieno transporto būdo. Pavyzdžiui, krovinys gali būti iškrautas iš laivo į sunkvežimį, kuris perkelia jį į racingard, iš kurio jis bus perkeltas visoje šalyje traukiniu. Intermodalinis transportas gali būti efektyvesnis ir pigesnis; tačiau kai kuriais atvejais jis turi didelių trūkumų greičio ir patikimumo požiūriu.
Greitis
Nors intermodalinis pervežimas yra naudingas palyginti mažoms sąnaudoms, palyginti su kitais metodais, tai jis gaunamas aukojant greitį; bet kuriuo metu krovinys perkeliamas į palyginti lėtesnes keliones, pavyzdžiui, traukinius, kurie veikia fiksuotais bėgiais, kurie negali pasiūlyti tiesioginio maršruto, nes keliai važiuoja, o tai lėtina. Kad veiktų didžiausiu efektyvumu, intermodalinis pervežimas taip pat turi sumažinti laiką, kurį laukia sandėliuose, kad naujasis vežėjas galėtų atvykti arba krovinys būtų iškrautas.
Patikimumo trūkumas
Atsižvelgiant į tai, kad intermodalinis vežimas priklauso nuo kelių tranzito būdų, bendras patikimumas yra mažesnis; auga skirtingų rūšių grandinė, taip pat padidėja bet kokio grandinės suskaidymo galimybė. Tai ypač problemiška, kai viena iš transporto rūšių yra geležinkelis; geležinkeliai yra labiau linkę į vėlavimą, atsiradusį dėl blogų oro sąlygų ar įrangos gedimo. Dėl šios priežasties vežėjai, kuriems reikalingas patikimas ir greitas transportas, greičiausiai apsvarstys intermodalines sistemas ir nerimą dėl greičio.
Žala
Kai krovinys turi būti maišomas, krovinių siuntėjai rizikuoja sugadinti žalą, nes krovinys perkeliamas iš vieno gabenimo būdo į kitą. Laimei, šis pavojus gali būti sušvelnintas, tačiau tai paprastai apima perpakavimą, pridedant daugiau tvirtinimo ir apsauginės medžiagos, nei paprastai būtų laikoma pakankama. Šis papildomas svoris ir sąnaudos iš dalies priešinasi intermodalinio vežimo privalumais energijos vartojimo efektyvumo ir sąnaudų požiūriu.
Aukštos infrastruktūros išlaidos
Intermodaliniai krovinių gabenimai taip pat kenčia nuo palyginti didelių infrastruktūros išlaidų. Konteineriai sumažino prekių gabenimo išlaidas ir sunkumus, standartizuodami jų formą; vežėjai gali lengvai perkelti tą patį konteinerį iš laivo į traukinį į sunkvežimį. Tačiau šių konteinerių tvarkymas reikalauja, kad krovinių siuntėjai turėtų sunkiųjų kranų ir įrangą, reikalingą dideliems konteineriams valdyti; ši infrastruktūra gali būti ne visose vietose, ypač besivystančiose šalyse.
